COVID-19

[eugenez 4670]

как по мне, хаером маловато трясёт.
но харизма достойная. 

[Carbofos 1491]

7 часов назад, eugenez сказал:

как по мне, хаером маловато трясёт.
но харизма достойная. 

Поп-рок

[eugenez 4670]

чот сразу негритянскую службу из Братьев Блюз вспомнил

там бразы с систерами отжыгают так, что не только коронавирус, а холера с сибирской язвой самоизгонятся.

[eugenez 4670]

Ну чо, пять-джы киборги есть? которые не засцали и привились?

сразу - я не, пока антител дофига, может к осени, смотря по динамике их паденья.

[elixir 212]

один без съемки прививается, другого складной иголкой прививают, такое это себе...

[ВЕТЕРАН 442]

Говорят, что после прививки сразу тянет в Крым, а мне больше в Горном нравится).

[SENEX M. 875]

Родственник работает в зоне риска, прививку в обязаловку, первый этап легко, второй суставы ломит сильно.

[eugenez 4670]

Родственники многие привились. У одних, помоложе, температурная реакция до 38 градусов первый день и 37.5 во второй, на обе вакцины. У других, постарше, первая без реакции, вторая - 37,5 и слабость в течение суток. Коллеги многие привились - ни у кого побочек не было.

после прививки сразу тянет в Крым

в крым тянет после открытия карты мир 

кстате. А знает ли уважаемый бомонд, что с 1, кажется, июля, все выплаты от государства - децкие там, соцстрах, больничные, маткапитал и т.п. - будут только на карту мир?

[SENEX M. 875]

7 часов назад, eugenez сказал:

будут только на карту мир?

Ай да Герман! Ай да ... 

работы давно ведутся, жену два года назад ещё заставили при оформлении пособия только на мир.

[eugenez 4670]

ну госслужащих - конкретно знаю про силовой блок, полиция там и т.п., ну и наверняка администрации всякие - году наверное в 15-16м перевели

[eugenez 4670]

а вот что касается антител - пока в голове картина не складывается. Слишком разные исходы в случаях, когда можно проследить динамику вакцинации.

Текущая динамика, кстати. С сентября по сей момент. Лиловая кривая - в госпиталях с подтверждённым ковидом, жёлтая - тяжёлые, зелёная - на ИВЛ, шкала для всех слева. Красные столбцы - ежедневное выявление, шкала справа. Что наблюдаем. Конкретно сегодня по выявлению - на уровне 2 октября. При этом госпитализированных было примерно столько же, тяжёлых 2 октября было меньше человек на 30. Сравнить если, психологическая обстановочка тогда и щас слегка различалась. Есть на эту тему догадки, но за них могут посадить, поэтому не буду

[eugenez 4670]

Сегодня первый раз с 1 или 2 октября меньше 100 заболевших (всё по оф. данным). И несколько дней подряд количество заболевших меньше, чем количество выздоровевших.

[Corleone 1178]

Сделал прививку добровольно 3 недели назад, никаких изменений состояния не было. Во вторник пойду делать вторую. Надеюсь не помру. 

Ковидом переболел в октябре, в лëгкой форме. 

[Окейгугл 306]

у нас на работе бесконтактную сантехнику обратно на нормальную поменяли. Правда, штрафовать за безмаски по 500 руб. пока не перестали

[eugenez 4670]

Трактат про антитела к SARS-CoV-2

Антитела - это белки сложной структуры, т.н. иммуноглобулины, у млекопитающих их 5 классов: A, G, M, E, D, у других животных бывают и другие. Отличия между классами Ig - в структуре (разные комбинации разных количеств тяжёлых и лёгких цепей) и функциях. В аспекте противоинфекционном работают первые три класса: A, G и M. С практической точки зрения и с т.з. доступности к измерению интересны два: M и G.

Дальше, когда пишу про антитела, всегда имею в виду антитела против конкретного возбудителя, они специфичны к возбудителю. Не бывает просто IgM, бывает анти-SARS-CoV-2-IgM, т.е. IgM, развившийся в ответ на инфекцию SARS-CoV-2 (вместо SARS можно подставить вирус гепатита С, вирус гриппа, вирус неведомой фигни и т.п.).

IgM - ранние антитела, развиваются как первичный ответ организма на инфекцию. Быстро появляются, на их фоне начинается и нарастает синтез антител IgG, после чего IgM быстро исчезают. В контексте ковида - выявляются со второй недели болезни, держатся до 3 месяцев.

IgG - антитела, обеспечивающие долговременный иммунитет к возбудителям, в контексте ковида - выявляются с третьей недели болезни, иногда раньше. Сколько держатся, достоверно пока неизвестно, у кого-то пропадают через 4-6 месяцев, у кого-то держатся дольше. 

Практическая трактовка простая. Есть IgM, нет IgG - острая фаза болезни, возможно выделение вируса, нужен ПЦР тест. Есть и IgG, и IgM - свежепереболевший выздоровевший либо болезнь в стадии выздоровления. Нет IgM, есть IgG - привитый или переболевший.

Пока просто. Дальше немного сложнее.

Коронавирус неоднороден и имеет в составе несколько белков, к которым могут развиваться и развиваются антитела.

Нуклеокапсидный белок N находится внутри вириона. Антитела к нему - показатель реакции организма на разрушенные вирионы. Анти-N IgG к коронавирусу НЕ ЗАЩИЩАЕТ от повторного заражения, эти антитела НЕ НЕЙТРАЛИЗУЮТ вирус. При вакцинации анти-N IgG может развиваться, а может и не развиваться. Исследовать его с целью интереса - а есть ли у меня иммунитет к коронавирусу? - бессмысленно.

Белок S (spike, шип) находится на шипах вирионов коронавируса. Именно S-протеин прикрепляется к рецепторам на поверхности клетки, после чего происходит внедрение вирусной РНК в клетку и запускается цикл репродукции вируса с последующей сборкой вирионов и разрушением клетки. Белок S состоит из двух субъединиц: S1 и S2. Непосредственный участок, который реагирует с клеточными рецепторами, находится в S1 субъединице и называется рецептор-связывающий домен (RBD, receptor binding domain). Антитела к RBD являются теми самыми вируснейтрализующими антителами, которые все хотят иметь и которые развиваются у большого процента переболевших и вакцинированных. Когда говорят о вируснейтрализующих (препятствующих проникновению в клетку вируса и т.о. развитию инфекционного процесса) антителах - имеют в виду анти-S1/RBD IgG.
При этом возможно развитие (вместе с анти-S1/RBD или изолированно) антител к S1/S2 белкам коронавируса. Эти антитела НЕ НЕЙТРАЛИЗУЮТ вирус, но предотвращают развитие тяжёлых форм инфекции.

Т.о., в данный момент наличие S1/RBD антител к коронавирусу класса IgG признаётся единственным фактором, способным предотвратить заражение.

Теперь про диагностику. В связи с авральностью ситуации нужны были хоть какие-то средства для диагностики иммунитета, поэтому производители наделали массу тест-систем, не совпадающих по составу антигенов (белков), антитела к которым выявляются, и результаты которых друг с другом почти никогда невозможно сопоставить.

Что имеем на сей момент

- тест-системы для выявления суммарных антител (сумма IgG и IgM). Появились в самом начале, для чего их использовать сейчас - уже непонятно. Обычно (ну, те, которые я видел или про которые читал) выявляются антитела IgG+IgM к S и N белкам в неизвестной пропорции. Для диагностики иммунитета непригодны, хотя и отреагируют на сыворотку переболевшего или привитого (за счёт любого компонента). Только понять, заразится или нет носитель таких антител, нельзя. Такие системы делает, например, Вектор-Бест и Диагностические системы. Все экспресс-тесты, которые мне попадались, выявляли суммарные антитела.

- тест-системы для выявления антител класса IgM. Для диагностики иммунитета непригодны, используют для контроля динамики заболевания. Обычно выявляются антитела к S и N белкам в неизвестной пропорции.

- тест-системы для выявления антител класса IgG. Ранние тест-системы определяли антитела к антигенам N (например, Abbott, используется в Инвитро) или смеси антигенов S и N в неизвестных пропорциях (Литех, Диагностические системы). Тест-системы более поздней разработки определяют антитела к S1/RBD белку (Beckman Coulter, Ниармедик) или к S1/S2 белку (Liaison (им работает Хеликс), Вектор-Бест).

- есть ещё тест-системы для выявления IgA к смеси N+S белков (Вектор-Бест например), но практически не сталкивался и особого понимания не имею. 

Выводы. 
1. Разные тест-системы не обязательно покажут одинаковый результат у одного человека (особенно это касается т.н. количественных исследований с результатом в виде разных попугаев типа коэф. позитивности или условных/относительных единиц - все они друг с другом несравнимы). Вполне реальны ситуации, когда S1/RBD антител у болевшего или привитого нет, а к S1/S2 - есть. Наоборот тоже, думаю, бывает. Если начали контролировать в одной лаборатории конкретной тест-системой - динамику контролируем там же, ну или ищем лабораторию, работающую такими же реагентами. Это же касается и попугаев - начали измерять в лаборатории с отн. единицами, там же и продолжаем, иначе что там булькает в организме в действительности, понять будет нельзя.

2. Что за антитела выявляются - лаборатория должна сообщать на берегу. И отражать это в результатах.

3. Для контроля вакцинации и вообще защищённости используем антитела к S1/RBD, а больше ничего не используем.

4. Если после вакцинации АТ к S1/RBD не выявляются - не паникуем, а исследуем АТ к S1/S2. Нашли - значит, не всё так плохо, это определённая страховка от тяжёлой формы коронавирусной инфекции. Не нашли - вакцинация была неэффективной

И табличка, составленная моим коллегой, описывающая примерно то же самое. Как видно, анти-N-антитела ничего нам не говорят, кроме факта заболевания в прошлом.

анти-N	анти-N+S/(S1+S2)	анти-S1+S2	анти-S1/RBD	Как интерпретировать
Abbott	Диагностические системы, Алкор Био, Литех	Вектор-Бест, LIAISON	Ниармедик, Beckman Coulter
+++	---	---	---	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, защитных антител нет
+++	+++	---	---	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, защитных антител нет
+++	+++	+++	---	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, антитела к S2 белку Риск заражения остается высоким, однако вероятность тяжелых форм низкая.
+++	+++	+++	+++	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, антитела к RBD Риск заражения очень низкий. Человек защищен от повторного инфицирования.
---	+++	+++	+++	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, антитела к RBD Риск заражения очень низкий. Человек защищен от повторного инфицирования.
---	+++	+++	---	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, антитела к S2 белку Риск заражения остается высоким, однако вероятность тяжелых форм низкая.
---	---	---	+++	Свидетельство перенесенной инфекции COVID-19, антитела к RBD Риск заражения очень низкий. Человек защищен от повторного инфицирования.

Не болейте

А, и самое главное-то. Всё вот это вот написанное не относится к вакцинации новосибирской ЭпиВакКороной. Я без понятия, как это концептуально обосновывает производитель, но якобы на антитела после этой вакцины реагирует только их же собственная тест-система, которая на данный момент коммерчески недоступна. А вот Спутник и вакцину института Чумакова контролировать, как я написал, можно.

[ВЕТЕРАН 442]

Огромное мерси. Остался ещё один важный момент - можно ли вакцинироваться, если есть анти-S1/RBD ? Ведь все эти передвижные пункты и сельские больнички ставят просто проходящим мимо.

[eugenez 4670]

Можно. Наличие любых антител к коронавирусу не противопоказание для вакцинации. Если уже есть нейтрализующие антитела - их количество возрастёт. Есть у меня в семье случай низкой концентрации антител после болезни, которыая после вакцинации возросла примерно почти в 8 раз - с трёх попугаев до двадцати трёх.

Другой вопрос, если концентрация антител исходно высока. Я бы в такой ситуации чуть подождал бы, до снижения. А уже потом привился.

[Corleone 1178]

Во вторник сделал вторую прививку, никаких изменений. Про антитела не знаю, на всë воля божья. 

[eugenez 4670]

Текущая ситуация по краю - рост числа заболевших (67 на вчера, красные столбцы), госпитализированных (лиловая кривая, 713 на вчера против 460 на 1.06). Неделю назад ИВЛ к тяжёлым относились как 1 к 3 (48/142 1 июня), сейчас - как 1 к 2 (96/204 на вчера; жёлтый график - тяжёлые, зелёный - ИВЛ). Прогнозы так себе.

[Robinson_Crusoe 286]

7 часов назад, eugenez сказал:

Текущая ситуация по краю - рост числа заболевших (67 на вчера, красные столбцы), госпитализированных (лиловая кривая, 713 на вчера против 460 на 1.06). Неделю назад ИВЛ к тяжёлым относились как 1 к 3 (48/142 1 июня), сейчас - как 1 к 2 (96/204 на вчера; жёлтый график - тяжёлые, зелёный - ИВЛ). Прогнозы так себе.

 

Делаем ставки на дублирование московских ограничений?

[eugenez 4670]

Пока не думаю, что ограничения будут. Приросты как в начале-середине мая, ещё не критично.

Будут смотреть на уровень рас[бииииип]ства на местности, кмк. А потом решат - крутануть или не трогать.

[Corleone 1178]

Если честно я так и не могу понять, а в чëм трудность сделать прививку?! 

Те кто не хочет делать- да ради бога, не делайте (как в любой демократической стране), но запретить им выход из дома и отменить для них бесплатное лечение в случае заболеваемости. Через 2 месяца не будет ни одного нового случая заражения. Одни будут привиты, другие помрут смертью храбрых не признающих никаких вакцин ковиддисседентов! 

[eugenez 4670]

потому что у нас тут кровавый и тоталитарный мордор, попирающий права, свободы и пр.

а в каком эльсиноре демократическом давно бы строем ходили под конвоем армии, авиации и флота.

[Окейгугл 306]

12 часов назад, Corleone сказал:

Если честно я так и не могу понять, а в чëм трудность сделать прививку?! 

я так понял у всех прививки (по крайней мере автомобилистов), раз я один в маске, как дурак, например, в Техномаркете на обеде

[eugenez 4670]

В техномаркете на обеде мы двое с тобой дураки. Я тоже туда в маске хожу. Везде грозные надписи - без маски вход запрещён и всё такое, а на деле забивайтунг. Да и в самом магазе примерно так же. Охранник в маске, и всё.